Esta línea se orienta a examinar cómo las actividades del sistema agroalimentario (y vinculados) y las políticas públicas relacionadas con las mismas (agraria, ambiental, energética, etc.) influyen en aspectos medioambientales clave como la conservación de recursos naturales, la biodiversidad, la contaminación, etc. Además, se analiza cómo estas actividades han contribuido históricamente y pueden contribuir al desarrollo sostenible, abordando también el diseño de políticas públicas que sean medioambiental y socialmente responsables. Además, se cuantifica el valor económico de los recursos naturales del medio rural para fomentar un desarrollo rural integrado y sostenible, garantizando al mismo tiempo la preservación y el uso eficiente de los recursos naturales, en particular, del agua.

Esta línea consta de cuatro sublíneas:

• Medición de los impactos de las actividades de la bioeconomía en el medioambiente y en los recursos naturales.
• Diseño y repercusión de los cambios en las distintas políticas públicas (agraria, energética, alimentaria, etc.) en las actividades de la bioeconomía y en los indicadores de los Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS).
• Valoración económica de los recursos naturales y desarrollo rural integrado.
• Estimaciones sobre usos de agua, agua virtual y gestión eficiente y sostenible de los recursos hídricos.